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蛋白質(zhì)印跡法中為什么檢測不到目的蛋白?
閱讀次數(shù):546 發(fā)布時間:2021/4/26 10:07:36
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很多小伙伴在對膠片印跡進行短暫曝光后,檢測不到目的蛋白。可從以下幾個方面來優(yōu)化實驗步驟:

1、裂解物制備

每道全細胞提取物的 20–30 ?g 總蛋白,通常足夠用來檢測。如果靶標蛋白的基礎水平,或蛋白質(zhì)修飾程度低,可能需要通過化學刺激劑來誘導表達或修飾。你可能要調(diào)查備選細胞系或組織,其所含的目的蛋白含量更高。應將樣品溶解于適當?shù)木彌_液中,該緩沖液包含蛋白酶抑制劑和針對磷酸化目標的磷酸酶抑制劑。應務必對裂解物進行超聲處理,以確保有效的染色質(zhì)和膜結合靶標的蛋白質(zhì)提取。請查看我們網(wǎng)站上的對照物表,獲得推薦的陽性對照物和處理方法。

2、抗稀釋和/或孵育

使用推薦的封閉劑(5% BSA 或 5% 脫脂奶粉),以推薦的稀釋度溶解于 TBST 中,在 4°C 下,過夜孵育抗。使用備選封閉劑,如明膠、血清、無蛋白封閉劑、酪蛋白、或混合封閉劑,可能降低靶標信號強度。如需單個抗體的優(yōu)化結果,請查詢產(chǎn)品數(shù)據(jù)表找到推薦的稀釋緩沖液。

3、SDS-PAGE 凝膠選擇

般來說,推薦采用 Tris-Glycine 凝膠。但是,對于高分子量蛋白質(zhì),我們推薦采用 Tris-Acetate 凝膠和相關緩沖液。蛋白質(zhì)從 1 毫米凝膠轉(zhuǎn)移比從 1.5 毫米凝膠轉(zhuǎn)移更有效。使用更厚的凝膠,可能會導致高分子量蛋白質(zhì)的轉(zhuǎn)移不完全,所以我們推薦監(jiān)測轉(zhuǎn)移效率,根據(jù)目的靶標蛋白質(zhì)分子量大小,優(yōu)化轉(zhuǎn)移條件。

4、轉(zhuǎn)移和膜

可通過延長轉(zhuǎn)移時間或使用更高的電壓,可改善轉(zhuǎn)膜不完全。般來說,我們建議在轉(zhuǎn)移緩沖液中加入 20% 甲醇,然后在 70 V 電壓下進行為時 2 小時的濕轉(zhuǎn)。對于高分子量蛋白質(zhì),我們建議減少轉(zhuǎn)移緩沖液中的甲醇至 5%,以提高轉(zhuǎn)移效率并避免大分子蛋白質(zhì)在凝膠基質(zhì)中固定,并且在 70 V 電壓下延長轉(zhuǎn)移時間至 3 小時。檢測較小的蛋白質(zhì)時,可能在轉(zhuǎn)膜期間出現(xiàn)過度轉(zhuǎn)移(過膜蛋白質(zhì)轉(zhuǎn)移)問題。對于小蛋白質(zhì)分子,使用孔隙大小為 0.2 ?m 的膜并在 70 V 電壓下進行為時 1.5 小時的濕轉(zhuǎn),而不是使用孔隙大小為 0.45 ?m 的膜或進行過夜轉(zhuǎn)移,這樣做很重要,因為后者可能會導致過度轉(zhuǎn)移和丟失小蛋白質(zhì)分子信號。

5、封閉

膜封閉時間過長可能會掩蓋抗原表位,并阻止抗體結合。在室溫下僅封閉 1 小時。

6、洗滌

洗滌時間超過推薦的三次 5 分鐘是個常見問題,可能會導致減少信號。我們推薦計時洗滌,以確保準確性。TBST 應包含 0.1% Tween? 20。這適用于抗和二抗孵育后的洗滌步驟。此外,我們建議在 TBST 中洗滌,因為已有數(shù)據(jù)顯示在 PBST 中洗滌會導致減少信號。

7、二抗稀釋和/或孵育

可用相同的細胞提取物和抗在印跡上進行二抗的梯度稀釋,以優(yōu)化二抗?jié)舛。務必在室溫下,在?5% 脫脂奶粉的 TBST 中孵育二抗 1 小時。避免在 HRP-偶聯(lián)二抗的緩沖液中加入疊氮/化鈉,因為疊氮化物會抑制 HRP 的活性。

8、檢測試劑

采用能用抗-生物素-HRP 進行檢測的生物素化分子量標準作為化學發(fā)光檢測的陽性對照物。
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